超14万种肠道病毒“墓葬”，人类肠道病毒的作用是什么？

Science daily

虽然肾脏有机体群人近年已是了研究课题热点，但是我们对它们的洞察依然有很多填补的地方，比如牵涉到到肾脏狂犬病，我们洞察的就更为极少了。

狂犬病是地球上为数一共的有机体实体，在人类所肾脏环境中的也不一般来说。2年末18日，Wellcome Sanger和EMBL-EBI研究课题所的研究课题职员在《细胞》（Cell）上面世的一项重磅研究课题，辨认出了生活在人类所肾脏中的的14万余种狂犬病，其中的一半以上的狂犬病现在认出。这个辨认出为地质学家肾脏狂犬病与蟑螂的关系以及它们如何严重影响人类所保健建起了新的研究课题捷径。

DOI：https ：//doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.029

人体肾脏中的存有的大多数狂犬病是糖蛋白。研究课题职员使用祥测序学原理，对28060个公共人类所肾脏元测序和从人类所肾脏人才的2898个蟑螂分离出来测序中的辨认出的狂犬病鸟类的有机体多元性同步进行分类，拿到了人类所肾脏糖蛋白多元性的全面视图。

以外最值得同样的人类所肾脏糖蛋白序列数据源

这一早先包含了肾脏糖蛋白的蟑螂母体分配和母体全域、人类所生活方式与糖蛋白并不一定的世界各地肾脏分布等内容。同时，研究课题职员辨认出了一个新的相对于普及的旁系，即两组成员被看来有协同后裔的狂犬病，并将其命名为Gubaphage。这是以外辨认出的人类所肾脏中的第二大普及的狂犬病旁系，三高2014年辨认出的crAssphage。

Gubaphage是肾脏中的非常极少见的演化出叉

糖蛋白演化出叉的辨认出是人类所肾脏中的相对于普及糖蛋白的又一典型范例，对其实质性人才和同步进行基本功能研究课题，可以希望我们更为好地洞察其在人类所肾脏乳糖中的的发挥作用。

同时，这个研究课题最终告诉我们，并非所有的狂犬病都是有害的，有时它们代表了肾脏生境必备的组成员成部分。因为研究课题中的的样品主要来自保健个体，他们没有人任何特殊的哮喘。同时，辨认出的大多数狂犬病都以DNA作为真核细胞，这与大多数人所熟知的细菌不同，如SARS-CoV-2或山后卡狂犬病等，它们是RNA狂犬病。因此可以肯定，人类所肾脏狂犬病测序具有牢固、多种不同、相对于形体的特征。

该研究课题的Senior糖蛋白研究课题正在经历一场革新。这个高质量、大规模的人类所肾脏狂犬病第一版来得正是时候，可以作为指导工作愿景狂犬病体研究课题的生态学和演化出分析的早先。”

人类所肾脏是一个令人难以置信的有机体多元性环境。而出名，我们肾脏有机体组成员的主因可能会会避免哮喘和繁杂的境况，如炎症性肠病、过敏症和痛风。但对于我们的肾脏蟑螂以及感染它们的狂犬病（糖蛋白）在人类所保健和哮喘中的所扮演的角色，人们洞察得相对较极少。部分理由是由于使用当前的祥测序学和有机体信息学方案和新科技分析存有即便如此。此前，人类所肾脏狂犬病被称之为“狂犬病暗物质”，因为其分类存有相对于变异，狂犬病数据源大多不值得同样。

随着更为多研究课题的浮现，人类所肾脏狂犬病多种生境已被看来与保健有关，还包括在营养不良和调控免疫中的起发挥作用，例如在HIV病人的严重传染病和炎症性肠病（IBD）等哮喘。地质学家看来，人类所肾脏狂犬病主要通过变动蟑螂多元性和加强高度DNA转移在塑造肾脏生境中的起着必备发挥作用。

2019年，来自美国哈佛的大学的研究课题职员用两组成员确认的人类所肾脏互利霉对动物模型同步进行定殖后，并通过共同点硫化糖蛋白捕猎。研究课题揭示，糖蛋白捕猎不仅直接严重影响易感霉，而且通过蟑螂间的相互发挥作用避免对其他蟑螂种类的连带严重影响。这些动物模型的老鼠代谢组成员学揭示了动物模型肾脏有机体群人中的的糖蛋白捕猎可以通过变动作准备小肠停滞性和消化道收缩等必备基本功能的更为为必备一氧化氮的高度来潜在地严重影响哺乳有机体母体。

糖蛋白在动物模型模型中的对肾脏乳糖和代谢组成员的动态调控。Cell Host & Microbe，DOI：https ：//doi.org/10.1016/j.chom.2019.05.001

当肾脏狂犬病生境主因时，可能会意味着哮喘的浮现。也有无论如何的证据暗示糖蛋白作准备了几种哮喘。例如，在一项关于IBD病人乳糖分类多种不同度的研究课题辨认出，与保健非常极少成员相较，IBD病人老鼠样品中的的Faecalibacterium prausnitzii（一种上会在IBD个体中的耗竭的蟑螂）的原糖蛋白更为极少见或更为多种不同，这暗示这些糖蛋白可能会在哮喘病理生理学中的发挥发挥作用。IBD与狂犬病组成员之间的这种关系也不仅限于人类所研究课题。曾有有机体实验揭示，在动物模型结肠炎中的，肾脏糖蛋白生境发生了类似人类所IBD病人中的观察到的成分转变，辨认出结肠炎有机体的糖蛋白生境多元性上升，糖蛋白子集缩减。

关于各种哮喘静止状态下人类所肾脏狂犬病体转变的部分研究课题。Studying the gut virome in the metagenomic era: challenges and perspectives.

狂犬病是肾脏平衡静止状态和炎症的必备调控器。在这方面，关于狂犬病体能够抑制停滞的低高度免疫，而不引发任何明显的症状的并能早已被记录在案，一般来说于一些有系统狂犬病，还包括疱疹狂犬病和多瘤狂犬病，以及一些个体中的的乙肝（HBV）和丙肝（HCV）狂犬病。有证据暗示，糖蛋白也可能会与人类所细菌直接相互发挥作用。例如，低剂量给制剂的糖蛋白在母体举例来说到系统组成员织中的，在那里触发先天性和适应性免疫。

然而，人们对糖蛋白引发先天性抗狂犬病免疫的基本功能知之甚极少。糖蛋白与细菌相互发挥作用的可能会基本功能是通过它们与蟑螂有机体组成员的协同点。一些蟑螂糖蛋白将互利霉作为自身测序的适配，在才会下，如传染病等情况下，诱导糖蛋白颗粒的表达，可被细菌检验到。其他糖蛋白通过产生能够修饰沙门氏霉、病原、录贺氏霉和霍乱弧霉等有机体中的脂多糖（LPS）的O-抗原成分的酶来调控蟑螂的抗原性。

因此，能够同样的是，尽管许多哮喘揭示与各种糖蛋白有关，但要确认共存法则却极为困难。此外，在这些协同点研究课题中的，不太可能会确认有机体组成员和狂犬病体的变动是哮喘的理由还是结果。

以外，世界各地的研究课题职员正着手研究课题人类所肾脏有机体组成员中的的古霉、真霉、蟑螂，以及狂犬病和蟑螂。人类所肾脏糖蛋白多元性早先的浮现，不可否认对研究课题人类所肾脏中的的有机体群人如何严重影响人类所保健和哮喘极为有用。而就在2020年7年末，EMBL–EBI的研究课题职员在《共存有机体新科技》（nature biotechnology）上同样面世了一份无与伦比的人类所肾脏生境清单，从人类所肾脏中的的4600多种蟑螂中的。愿景我们能够好好的，就是把两份早先联系起来，揭开肾脏狂犬病、蟑螂间的联系。

来自人类所肾脏有机体组成员的204938个参考测序的分立第一版。A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.

总之，肾脏有机体组成员早先的手绘是该研究课题领域的必备里程碑惨案，将已是地质学家开始研究课题并努力洞察每个有机体种在人类所肾脏生境中的发挥作用的难得森林资源。努力我们能在愿景说明狂犬病、蟑螂等有机体群人与母体保健和哮喘之间确认关系。